Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mindy1Q76LS9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms