Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms