Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SynmQ70IV5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynmQ70IV5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms