Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps27Q6ZWU9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms