Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms