Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms