Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms