Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Efr3bQ6ZQ18 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Efr3bQ6ZQ18 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Efr3bQ6ZQ18 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Efr3bQ6ZQ18 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Efr3bQ6ZQ18 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Efr3bQ6ZQ18 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Efr3bQ6ZQ18 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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