Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a1Q6X893 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms