Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms