Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rhox8Q6VSS7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rhox8Q6VSS7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms