Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms