Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja6Q6S5G4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms