Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn2Q6PHP6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms