Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms