Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tmeff1Q6PFE7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms