Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms