Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms