Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sarm1Q6PDS3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sarm1Q6PDS3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sarm1Q6PDS3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms