Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms