Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RgmaQ6PCX7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms