Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Zbtb40Q6PCS8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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