Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms