Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gga2Q6P5E6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga2Q6P5E6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms