Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms