Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo3Q6P2B1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms