Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Szrd1Q6NXN1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms