Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic1Q6NXK8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms