Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms