Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms