Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms