Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms