Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms