Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm4Q6IRU2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms