Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt77Q6IFZ6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms