Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms