Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms