Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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