Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms