Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms