Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms