Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VclQ64727 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VclQ64727 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VclQ64727 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VclQ64727 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VclQ64727 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VclQ64727 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VclQ64727 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VclQ64727 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VclQ64727 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms