Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms