Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms