Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms