Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms