Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms