Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm20854Q62461 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm20854Q62461 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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