Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms