Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sp4Q62445 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms